（4）及时扣回应扣款项，拒绝计量和支付任何不符合合同规定的款项。
（5）严格审核细目是否有重复计量现象。如涵洞以延米综合单价计量，则其挖基、回填、基础垫层、出入口铺砌均不能再单独计量。
3、严格管理工程变更
工程变更是建设项目投资控制的重点难点，是施工阶段影响工程造价最大的因素。工程变更与一般的合同变更相比有自己的法律特征。主要如下：(1)工程变更具有强制性。按照合同法的规定，工程变更与应建立在合同双方协商一致的基础上，没有业主或承包商的事先同意是不能进行工程变更的，但在FIDIC条款规定中，工程变更并不是以业主和承包商的协商一致为前提。只要工程变更在客观上需要发生，监理工程师可以在业主批准后提出，而承包商在接到监理工程师的变更指示后必须执行。(2)工程变更令是工程变更有效成立的前提。合同法规定，合同双方达成的变更协议是执行合同变更的依据，没有变更协议的合同变更是一种无效变更或擅自变更合同的行为。而在FIDIC条款规定的工程变更中有所不同，其特点是监理工程师下达的工程变更令是工程变更效成立的依据，而没有监理工程师变更令的变更是一种无效变更或擅自变更的行为，监理工程师有权不予签证。工程变更按引发的原因不同又可分为如下几类：
（1）因设计不合理而引起的工程变更
（2）业主想扩大工程规模、提高设计标准或加快施工进度而出现的工程变更
（3）为满足地方政府的要求而不得不进行的工程变更
（4）为优化设计方案而出现的工程变更
（5）因雇主风险或监理工程师责任等原因而引起的工程变更
（6）因承包商的施工质量事故而引起的工程变更，由承包商承担由此增加的全部费用。
在工程项目的实施过程中，经常会碰到来自业主对项目要求的修改、设计单位由于业主要求的变化或现场施工环境、施工技术的要求而产生的设计变更等。由于这多方面的变更，经常出现工程量的变化、施工进度变化、业主与承包商在执行合同中的争执等问题。这些问题的产生，一方面是由于主观原因，如勘察设计工作深度不足，以致在施工过程中发现许多招标文件中没有考虑或估算不准确的工程量，因而不得不改变施工项目或增减工程量，另一方面是由于客观原因，如发生不可预见的事故，自然或社会原因引起的停工和工期拖延等，致使工程变更不可避免。
3.1 审核工程变更是否必要
尽管工程变更类型很多，但变更工程一般应是原合同中已有的同类型工程。例如：当合同中本已存在桥梁工程时，则将高路堤改成高架桥的工程变更是可以考虑的，反之，是要限制甚至是不允许的。因为当原合同中无桥梁工程项目时，意味着招标或资格预审时，并未对承包商的桥梁工程施工业绩和施工能力进行审查，承包商不一定能胜任桥梁工程的施工。这种变更会使质量控制难度增大，甚至会出现重大质量问题。同时可能会引发大量施工索赔。而且会增大工程结算和投资控制的难度，工程量清单中不可能有相应的计价项目和计价依据，变更工程的单价被迫要重新协商。原有的招标成果无法有效发挥作用。
不管何种形式的工程变更，都是以保证工程质量为前提条件的，保证工程质量也是保证经济效益重要基础，以牺牲工程质量为代价的工程变更是不可取的，
照顾当地经济利益，最大限度地发挥公路建设项目的社会效益，是公路建设项目的客观要求。公路建设项目是一种为全社会服务的公共设施，其社会公益性使得公路建设项目的效益首先表现为一种国民经济效益和社会效益。所以优化设计方案，最大限度地发挥公路建设项目的社会服务功能，照顾当地经济利益，是处理工程变更的基本原则之一。
工程变更通常会带来工程投资的变更，且以工程造价的增涨情况居多，这一方面会增加业主筹措资金的压力，另一方面还会影响社会资金的供求平衡。所以在审核工程变更的过程中，应将工程造价的控制放在重要地位，力保工程造价不超过设计概算。当超过设计概算甚至投资估算的重大设计变更不可避免地需要发生，业主应会同监理工程师、造价工程师一道进行详细地可行性研究和工程变更的评估工作，之后报国家计划主管机关批准后方能实施工程造价的工程变更，须认真地进行可行性研究和技术经济论证评估，确保工程变更的经济效果。
